يرومُ هذا البحث إلى دراسة المسائل الخلافية النّحوية التي خالف المخزومي فيها البصريين ووافق الكوفيين الواردة في مؤلفاته ، وعُني هذا  البحث بعرض الخلاف النحوي بين نحويي المدارس النحوية في كل مسألة ومن ثم عرض رأي مهدي المخزومي في هذه المسائل ، ويهدف هذا البحث إلى تسليط الضوء على آراء مهدي المخزومي في مسائل الخلاف النحوي وبيان موقفه منها و كيف تناولها بالشرح والنقد ، وبيان موقفه من آراء البصريين وآراء الكوفيين ، وبيان موقفه من العامل النحوي وهل استطاع أن يجد بديلًا مناسبًا عن نظرية العامل .